Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC14Q49A88 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC14Q49A88 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms