Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNF212Q495C1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms