Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BBS9Q3SYG4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms