Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT71Q3SY84 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms