Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTU2Q2VPK5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTU2Q2VPK5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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