Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms