Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GEN1Q17RS7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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