Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IMPG1Q17R60 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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