Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP1R3AQ16821 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms