Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM1Q16610 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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