Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FXNQ16595 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FXNQ16595 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FXNQ16595 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FXNQ16595 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FXNQ16595 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FXNQ16595 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FXNQ16595 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FXNQ16595 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FXNQ16595 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FXNQ16595 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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