Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC6Q16204 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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