Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
NCOA1Q15788 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms