Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP13Q15645 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP13Q15645 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP13Q15645 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIP13Q15645 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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