Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms