Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELOBQ15370 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELOBQ15370 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms