Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GAPVD1Q14C86 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
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