Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC10A1Q14973 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC10A1Q14973 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms