Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF235Q14590 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF235Q14590 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms