Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1CQ13936 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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