Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKD2Q13563 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
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