Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPM6BQ13491 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPM6BQ13491 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms