Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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