Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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