Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF6Q13247 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms