Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHAF1BQ13112 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHAF1BQ13112 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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