Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
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