Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF2Q12947 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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FOXF2Q12947 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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FOXF2Q12947 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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FOXF2Q12947 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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