Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPN13Q12923 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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