Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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