Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 MDM30YLR368W 1797 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 TGL4YKR089C 2733 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 UBP12YJL197W 3765 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 HCS1YKL017C 2052 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YLR001CYLR001C 2589 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 NOP6YDL213C 678 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 ARO2YGL148W 1131 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 RPS21BYJL136C 264 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YBL028CYBL028C 321 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YPL080CYPL080C 327 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 GRC3YLL035W 1899 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YKL100CYKL100C 1764 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 GAD1YMR250W 1758 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YFH1YDL120W 525 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 PSY1YKL076C 384 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 RKM1YPL208W 1752 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 CDC15YAR019C 2925 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 TIF4631YGR162W 2859 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 SEC6YIL068C 2418 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 SAE3YHR079C-A 276 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 PAU14YIL176C 363 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 PAU1YJL223C 363 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 LCL2YLR104W 396 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YPL025CYPL025C 558 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YPR136CYPR136C 513 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YJL016WYJL016W 1686 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 LCB4YOR171C 1875 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 SSB1YDL229W 1842 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 FRE4YNR060W 2160 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 TAR1YLR154W-C 375 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 BYE1YKL005C 1785 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 SNX41YDR425W 1878 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 GDE1YPL110C 3672 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 KIN82YCR091W 2163 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 BEM4YPL161C 1902 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 KRI1YNL308C 1776 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 YEL075CYEL075C 369 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 ISA1YLL027W 753 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 COA4YLR218C 453 nt3.97□□□□□ -1.77
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TY1A-NL1Q12391 PFY1YOR122C 381 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 BNA4YBL098W 1383 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 VPS73YGL104C 1461 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 PIN4YBL051C 2007 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 VID30YGL227W 2877 nt3.96□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 PCF11YDR228C 1881 nt3.96□□□□□ -1.77
TY1A-NL1Q12391 FUS1YCL027W 1539 nt3.96□□□□□ -1.78
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TY1A-NL1Q12391 RPL40AYIL148W 387 nt3.96□□□□□ -1.78
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TY1A-NL1Q12391 NTC20YBR188C 423 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 REB1YBR049C 2433 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 TDA1YMR291W 1761 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 MIP6YHR015W 1980 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 DAP2YHR028C 2457 nt3.96□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 VPS52YDR484W 1926 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 EMP70YLR083C 2004 nt3.95□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YKL222CYKL222C 2118 nt3.95□□□□□ -1.78
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TY1A-NL1Q12391 SCW11YGL028C 1629 nt3.94□□□□□ -1.78
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TY1A-NL1Q12391 CBP2YHL038C 1893 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 ALR2YFL050C 2577 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 ROK1YGL171W 1695 nt3.94□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 STN1YDR082W 1485 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 PUB1YNL016W 1362 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 MET12YPL023C 1974 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 LYS2YBR115C 4179 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 GPI14YJR013W 1212 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YKL111CYKL111C 336 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 TVP18YMR071C 504 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 YBR064WYBR064W 429 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 FEX2YPL279C 1128 nt3.93□□□□□ -1.78
TY1A-NL1Q12391 GAC1YOR178C 2382 nt3.93□□□□□ -1.78
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