Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 RPS16AYMR143W 432 nt2.29□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 YNL235CYNL235C 432 nt2.29□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 YPL068CYPL068C 882 nt2.29□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 YPR170CYPR170C 336 nt2.29□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 RGR1YLR071C 3249 nt2.29□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 STI1YOR027W 1770 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 DBF20YPR111W 1695 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 KHA1YJL094C 2622 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 MLH1YMR167W 2310 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 APC9YLR102C 798 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 RPL19BYBL027W 570 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 YOR055WYOR055W 435 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 GIN4YDR507C 3429 nt2.28□□□□□ -2.04
TIR4Q12218 TRA1YHR099W 11235 nt2.28□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 BIT61YJL058C 1632 nt2.28□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YJL132WYJL132W 2253 nt2.28□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 UTP15YMR093W 1542 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YDR338CYDR338C 2088 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SRB4YER022W 2064 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 AVT2YEL064C 1443 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SNA4YDL123W 423 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YDR029WYDR029W 315 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YDR090CYDR090C 933 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 FIN1YDR130C 876 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 HPA3YEL066W 540 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 TDA2YER071C 381 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YBR062CYBR062C 543 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 NTC20YBR188C 423 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RPO41YFL036W 4056 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 PSK1YAL017W 4071 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SHS1YDL225W 1656 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YHR078WYHR078W 1659 nt2.27□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 PDS5YMR076C 3834 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YBT1YLL048C 4986 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 BUD19YJL188C 309 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SRL3YKR091W 741 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RPL20AYMR242C 519 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YOR283WYOR283W 693 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RRD2YPL152W 1077 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YBR071WYBR071W 636 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YBR209WYBR209W 318 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 IKI3YLR384C 4050 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RSE1YML049C 4086 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 JJJ2YJL162C 1752 nt2.26□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YNL193WYNL193W 1677 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RPN3YER021W 1572 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 FAR7YFR008W 666 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SLX9YGR081C 633 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RSR1YGR152C 819 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 LRP1YHR081W 555 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 BAT1YHR208W 1182 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YHR213WYHR213W 597 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 APQ13YJL075C 417 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RLP24YLR009W 600 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YAR062WYAR062W 597 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 ILV5YLR355C 1188 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 MPP6YNR024W 561 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 ARF3YOR094W 552 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YBR051WYBR051W 351 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 URB2YJR041C 3525 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 CSF1YLR087C 8877 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SMC2YFR031C 3513 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 CTF13YMR094W 1437 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 PDR1YGL013C 3207 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 ARK1YNL020C 1917 nt2.25□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 NEL1YHR035W 1893 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 HYP2YEL034W 474 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 PRS3YHL011C 963 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YJL119CYJL119C 324 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 RPL8BYLL045C 771 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YLR202CYLR202C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 ATP18YML081C-A 180 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SAS2YMR127C 1017 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 AIM36YMR157C 768 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YNL150WYNL150W 408 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 VHR1YIL056W 1923 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 KAR9YPL269W 1935 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YDR239CYDR239C 2364 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 PCK1YKR097W 1650 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 CAF120YNL278W 3183 nt2.24□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 PSD2YGR170W 3417 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SVL3YPL032C 2478 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 TMA64YDR117C 1698 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 CRD1YDL142C 852 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YDR115WYDR115W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 NCB2YDR397C 441 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SDL1YIL167W 633 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 CWC24YLR323C 780 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YMR187CYMR187C 1296 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 YPR172WYPR172W 603 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 TIM12YBR091C 330 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 SCY1YGL083W 2415 nt2.23□□□□□ -2.05
TIR4Q12218 DSF2YBR007C 2211 nt2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms