Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YBR013CYBR013C 390 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 SME1YOR159C 285 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 BTS1YPL069C 1008 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 SAP185YJL098W 3177 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 INP53YOR109W 3324 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YEL043WYEL043W 2871 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 BRE1YDL074C 2103 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 GOS1YHL031C 672 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YLL044WYLL044W 447 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RPS17AYML024W 411 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RGM1YMR182C 636 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 DYN3YMR299C 939 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 IGO1YNL157W 507 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MER1YNL210W 813 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 DGK1YOR311C 873 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RPC40YPR110C 1008 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 UTP22YGR090W 3714 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 FUS2YMR232W 2034 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 AEP1YMR064W 1557 nt1.89□□□□□ -2.11
USB1Q12208 CLN3YAL040C 1743 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 COG3YER157W 2406 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MPH1YIR002C 2982 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 USO1YDL058W 5373 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 DNF1YER166W 4716 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 UBC9YDL064W 474 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 NRG1YDR043C 696 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 DPP1YDR284C 870 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YEL057CYEL057C 702 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RPL22BYFL034C-A 369 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 AAD16YFL057C 459 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YFR054CYFR054C 579 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YGL039WYGL039W 1047 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YGL242CYGL242C 546 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YJL114WYJL114W 681 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 ATG10YLL042C 504 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YLR169WYLR169W 354 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YML094C-AYML094C-A 402 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YOL107WYOL107W 1029 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RSA1YPL193W 1146 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YPR014CYPR014C 330 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MSS18YPR134W 807 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 NPR3YHL023C 3441 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MSL5YLR116W 1431 nt1.88□□□□□ -2.11
USB1Q12208 FKS1YLR342W 5631 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 URK1YNR012W 1506 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 GIC2YDR309C 1152 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 SDC1YDR469W 528 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 GCN4YEL009C 846 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 PEA2YER149C 1263 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YGR053CYGR053C 852 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MVB12YGR206W 306 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 LSM12YHR121W 564 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 VPS51YKR020W 495 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YKE2YLR200W 345 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YIP3YNL044W 531 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 VAM3YOR106W 852 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YOR283WYOR283W 693 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 HUA2YOR284W 732 nt1.87□□□□□ -2.11
USB1Q12208 PCK1YKR097W 1650 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 IRC8YJL051W 2469 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 GIS1YDR096W 2685 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RPN9YDR427W 1182 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 FAR3YMR052W 615 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YNL089CYNL089C 477 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 HEM4YOR278W 828 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 PIG2YIL045W 1617 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 REV3YPL167C 4515 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MCD1YDL003W 1701 nt1.86□□□□□ -2.11
USB1Q12208 SPT14YPL175W 1359 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 IST2YBR086C 2841 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 SHR3YDL212W 633 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 TIF35YDR429C 825 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YER046W-AYER046W-A 330 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RPS24AYER074W 408 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 ACB1YGR037C 264 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 CUP1-1YHR053C 186 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 CUP1-2YHR055C 186 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 ATP7YKL016C 525 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YKL115CYKL115C 393 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 TYE7YOR344C 876 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 SSE1YPL106C 2082 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 CBF2YGR140W 2871 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 KAR1YNL188W 1302 nt1.85□□□□□ -2.11
USB1Q12208 ASI3YNL008C 2031 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 GIP3YPL137C 3831 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 MAK11YKL021C 1407 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 UFD4YKL010C 4452 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 UBR1YGR184C 5853 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 TVP15YDR100W 432 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RUB1YDR139C 234 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 GUK1YDR454C 564 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 RRF1YHR038W 693 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 CKA1YIL035C 1119 nt1.84□□□□□ -2.11
USB1Q12208 AIM23YJL131C 1071 nt1.84□□□□□ -2.11
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