Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 SNX41YDR425W 1878 nt2.33□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 SRB4YER022W 2064 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YEL1YBL060W 2064 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 NRG1YDR043C 696 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YER189WYER189W 369 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 CUP1-1YHR053C 186 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 CUP1-2YHR055C 186 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 CMC1YKL137W 336 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 NYV1YLR093C 762 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YLR198CYLR198C 360 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YAP7YOL028C 738 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 IRC13YOR235W 315 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 INP51YIL002C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 BAS1YKR099W 2436 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YOL098CYOL098C 3114 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 MYO4YAL029C 4416 nt2.32□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 MGM1YOR211C 2646 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 LSM4YER112W 564 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YGL204CYGL204C 306 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 TWF1YGR080W 999 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YIL141WYIL141W 390 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 AIM23YJL131C 1071 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 UTP30YKR060W 825 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YLL044WYLL044W 447 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YOL162WYOL162W 648 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 ALY1YKR021W 2748 nt2.31□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 TFC3YAL001C 3483 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 TPS2YDR074W 2691 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 PUF4YGL014W 2667 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YPR097WYPR097W 3222 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 VPS25YJR102C 609 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 ARC18YLR370C 537 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 IRC21YMR073C 606 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 PEX17YNL214W 600 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YBR013CYBR013C 390 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 snR44snR44 211 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 CST9YLR394W 1449 nt2.3□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 BI3Q0115 1554 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YCT1YLL055W 1596 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 BUD26YDR241W 288 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YFR054CYFR054C 579 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YGL177WYGL177W 348 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YIL012WYIL012W 342 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 VPH2YKL119C 648 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YLR302CYLR302C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 FYV6YNL133C 522 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 ARF3YOR094W 552 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 DAD3YBR233W-A 285 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 APA1YCL050C 966 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YEL043WYEL043W 2871 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 PEP1YBL017C 4740 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 IRC8YJL051W 2469 nt2.29□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 TRM82YDR165W 1335 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 RGA2YDR379W 3030 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 HTD2YHR067W 843 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 POL32YJR043C 1053 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YLR169WYLR169W 354 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 SIP18YMR175W 240 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 RPL36AYMR194W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 DIA1YMR316W 1011 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 YMR320WYMR320W 306 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 MRPL17YNL252C 846 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 ASI3YNL008C 2031 nt2.28□□□□□ -2.04
TY3A-GQ12173 IRC20YLR247C 4671 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 AFI1YOR129C 2682 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 RTT107YHR154W 3213 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 DIS3YOL021C 3006 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 DPP1YDR284C 870 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 SDC1YDR469W 528 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 YGL039WYGL039W 1047 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 IKI1YHR187W 930 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 RGM1YMR182C 636 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 DYN3YMR299C 939 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 YNL089CYNL089C 477 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 AME1YBR211C 975 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 YIL080WYIL080W 4722 nt2.27□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 YPK1YKL126W 2043 nt2.26□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 MIG2YGL209W 1149 nt2.26□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 RTS3YGR161C 792 nt2.26□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 CCE1YKL011C 1062 nt2.26□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 ESF2YNR054C 951 nt2.26□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 BTS1YPL069C 1008 nt2.26□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 MAL33YBR297W 1407 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 SFB2YNL049C 2631 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 SPT14YPL175W 1359 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 ARP5YNL059C 2268 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 UBC9YDL064W 474 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 BRE1YDL074C 2103 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 YDR203WYDR203W 318 nt2.25□□□□□ -2.05
TY3A-GQ12173 MEI4YER044C-A 1227 nt2.25□□□□□ -2.05
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