Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 NMA111YNL123W 2994 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YLR001CYLR001C 2589 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YIL175WYIL175W 318 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 TVP18YMR071C 504 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 RPL23AYBL087C 414 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 HSP10YOR020C 321 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 HEF3YNL014W 3135 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 MDN1YLR106C 14733 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 AKR1YDR264C 2295 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 VPS3YDR495C 3036 nt3.95□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 SRC1YML034W 2505 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YDR269CYDR269C 324 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 RPS23AYGR118W 438 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YHR125WYHR125W 306 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 PKR1YMR123W 369 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YOR029WYOR029W 336 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 FAS1YKL182W 6156 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.94□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 MRP8YKL142W 660 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 MRP49YKL167C 414 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 RMP1YLR145W 606 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YNL179CYNL179C 438 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 HEM4YOR278W 828 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 IRC16YPR038W 360 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YMR018WYMR018W 1545 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 ALA1YOR335C 2877 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 SQS1YNL224C 2304 nt3.93□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 SMC2YFR031C 3513 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 RUD3YOR216C 1455 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 XRN1YGL173C 4587 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 SHQ1YIL104C 1524 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 SMB1YER029C 591 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YER135CYER135C 393 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 RTR1YER139C 681 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YLR302CYLR302C 363 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 RAD33YML011C 534 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 HHT2YNL031C 411 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YOL159CYOL159C 516 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YPL080CYPL080C 327 nt3.92□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 SEA4YBL104C 3117 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YER079WYER079W 633 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 MRPL38YKL170W 417 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YAR047CYAR047C 321 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 UTP13YLR222C 2454 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YJR030CYJR030C 2238 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 NOP4YPL043W 2058 nt3.91□□□□□ -1.78
SSF2Q12153 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YOL150CYOL150C 312 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 MSS18YPR134W 807 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 CWC22YGR278W 1734 nt3.9□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 SPE1YKL184W 1401 nt3.89□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 NUP60YAR002W 1620 nt3.89□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YDR090CYDR090C 933 nt3.89□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 CMC2YBL059C-A 330 nt3.89□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 SPA2YLL021W 4401 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 TFB1YDR311W 1929 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 MSR1YHR091C 1932 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 STE14YDR410C 720 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 SDP1YIL113W 630 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YPL034WYPL034W 498 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 BIT61YJL058C 1632 nt3.88□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 TFC1YBR123C 1950 nt3.87□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.87□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 TCD1YHR003C 1290 nt3.87□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 IRC19YLL033W 693 nt3.87□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 SWD3YBR175W 948 nt3.87□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 EPL1YFL024C 2499 nt3.87□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 MDV1YJL112W 2145 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 DAS1YJL149W 1992 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 PAU10YDR542W 363 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 RPL29YFR032C-A 180 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 PAU11YGL261C 363 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YHR138CYHR138C 345 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 ANB1YJR047C 474 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YLR230WYLR230W 306 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 PAU4YLR461W 363 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 RPS7AYOR096W 573 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 TIM12YBR091C 330 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YNR063WYNR063W 1824 nt3.86□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 FLO5YHR211W 3228 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 GLC3YEL011W 2115 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YPS5YGL259W 498 nt3.85□□□□□ -1.79
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