Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 GRS2YPR081C 1857 nt3.64□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 CDC45YLR103C 1953 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 SKN7YHR206W 1869 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 SRC1YML034W 2505 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 FMP10YER182W 735 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 OST6YML019W 999 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 VTI1YMR197C 654 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 ELM1YKL048C 1923 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 VIP1YLR410W 3441 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 EMC1YCL045C 2283 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 AIP1YMR092C 1848 nt3.63□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 ARG5,6YER069W 2592 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 MAL33YBR297W 1407 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YGL152CYGL152C 678 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 PAU13YHL046C 363 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YLR230WYLR230W 306 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 PEX5YDR244W 1839 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 SEC6YIL068C 2418 nt3.62□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 AAD16YFL057C 459 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YGR051CYGR051C 324 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 PEX4YGR133W 552 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 LAG1YHL003C 1236 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YAR029WYAR029W 225 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 AIM32YML050W 936 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 UBC7YMR022W 498 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 PEX17YNL214W 600 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 MRPL50YNR022C 420 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YDR061WYDR061W 1620 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 PMT6YGR199W 2280 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 RPO21YDL140C 5202 nt3.61□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 TRK1YJL129C 3708 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 GSC2YGR032W 5688 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 MCD4YKL165C 2760 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 Q0032Q0032 291 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YDL068WYDL068W 330 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 ARF1YDL192W 546 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 VEL1YGL258W 621 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YLR302CYLR302C 363 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 LDS2YOL047C 1071 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 HBT1YDL223C 3141 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 SPT23YKL020C 3249 nt3.6□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YDR089WYDR089W 2610 nt3.59□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 RNR4YGR180C 1038 nt3.59□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 COX19YLL018C-A 297 nt3.59□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 GTT2YLL060C 702 nt3.59□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.59□□□□□ -1.83
UPC2Q12151 CPA2YJR109C 3357 nt3.59□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 LCB4YOR171C 1875 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 NIC96YFR002W 2520 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 GRX2YDR513W 432 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 IES6YEL044W 501 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 SIP18YMR175W 240 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YNL179CYNL179C 438 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YPL142CYPL142C 318 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YJR003CYJR003C 1560 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 RDS1YCR106W 2499 nt3.58□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 TRS120YDR407C 3870 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YEL057CYEL057C 702 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 TAF6YGL112C 1551 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 PBS2YJL128C 2007 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 ERB1YMR049C 2424 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 HSP10YOR020C 321 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 ATP3YBR039W 936 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YPL039WYPL039W 951 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 SEG1YMR086W 2883 nt3.57□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 MAK5YBR142W 2322 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YKL222CYKL222C 2118 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 SRB4YER022W 2064 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 SPT10YJL127C 1923 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 SNT1YCR033W 3681 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 APE2YKL157W 2859 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 RRN6YBL014C 2685 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 FRQ1YDR373W 573 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YFL032WYFL032W 321 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YOR385WYOR385W 873 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YRM1YOR172W 2361 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 JEN1YKL217W 1851 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 SSP1YHR184W 1716 nt3.56□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 CWH41YGL027C 2502 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 TCB3YML072C 4638 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 FLO10YKR102W 3510 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 RRT13YER066W 558 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 RTT105YER104W 627 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 RPS0AYGR214W 759 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 HHT2YNL031C 411 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YOR225WYOR225W 330 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 KRI1YNL308C 1776 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 DIE2YGR227W 1578 nt3.55□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 MKT1YNL085W 2493 nt3.54□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 MSD1YPL104W 1977 nt3.54□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YLR001CYLR001C 2589 nt3.54□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 RPS26BYER131W 360 nt3.54□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YGL074CYGL074C 327 nt3.54□□□□□ -1.84
UPC2Q12151 YGR025WYGR025W 303 nt3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms