Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 TPO2YGR138C 1845 nt5.09□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YBR238CYBR238C 2196 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 UBX7YBR273C 1311 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 FRQ1YDR373W 573 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 BCD1YHR040W 1101 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 LSM2YBL026W 288 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 EGD1YPL037C 474 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 DBP6YNR038W 1890 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 GLT1YDL171C 6438 nt5.08□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 SIP1YDR422C 2448 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YLR001CYLR001C 2589 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YEL075CYEL075C 369 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 RPL34AYER056C-A 366 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YER188C-AYER188C-A 300 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YER189WYER189W 369 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 COX18YGR062C 951 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 RPL34BYIL052C 366 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YJR023CYJR023C 402 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 ATG33YLR356W 594 nt5.07□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 SGO1YOR073W 1773 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 RIM15YFL033C 5313 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 SIN4YNL236W 2925 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YBL028CYBL028C 321 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 GAD1YMR250W 1758 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 EMP70YLR083C 2004 nt5.06□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 EPO1YMR124W 2832 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 COG8YML071C 1824 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 IRC3YDR332W 2070 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YDR048CYDR048C 315 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YKL111CYKL111C 336 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 RPB11YOL005C 363 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 NTC20YBR188C 423 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 ULP1YPL020C 1866 nt5.05□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 PUT2YHR037W 1728 nt5.04□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 BFA1YJR053W 1725 nt5.04□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 CAF4YKR036C 1932 nt5.04□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YIL102CYIL102C 306 nt5.04□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 YKL222CYKL222C 2118 nt5.04□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 FRE4YNR060W 2160 nt5.04□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 SWC3YAL011W 1878 nt5.03□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 STB2YMR053C 2553 nt5.03□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 STE14YDR410C 720 nt5.03□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 CDC26YFR036W 375 nt5.03□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 HIR2YOR038C 2628 nt5.03□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 TIF4632YGL049C 2745 nt5.03□□□□□ -1.6
TFB4Q12004 HOT1YMR172W 2160 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YMR196WYMR196W 3267 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 COX1Q0045 1605 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 ATP22YDR350C 2055 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 HTA1YDR225W 399 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 DAD4YDR320C-A 219 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 RPL29YFR032C-A 180 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 RPL37AYLR185W 267 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 SUI1YNL244C 327 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 TIF4631YGR162W 2859 nt5.02□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 PAU2YEL049W 363 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YER091C-AYER091C-A 222 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 RPS26BYER131W 360 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YHL042WYHL042W 453 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 TUB2YFL037W 1374 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 KEX1YGL203C 2190 nt5.01□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 MZM1YDR493W 372 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 RPL36BYPL249C-A 303 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 TDA1YMR291W 1761 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 UBP12YJL197W 3765 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 GAL10YBR019C 2100 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 ECM25YJL201W 1800 nt5□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 BEM4YPL161C 1902 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 VID30YGL227W 2877 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YHR078WYHR078W 1659 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YDR061WYDR061W 1620 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 RPL14BYHL001W 417 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 HTB2YBL002W 396 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 YNL010WYNL010W 726 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 REB1YBR049C 2433 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 PBS2YJL128C 2007 nt4.99□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 VPS55YJR044C 423 nt4.98□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 ECM15YBL001C 315 nt4.98□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 SHH3YMR118C 591 nt4.98□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 MDM32YOR147W 1869 nt4.98□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 DNM1YLL001W 2274 nt4.98□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 SSB1YDL229W 1842 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 SSB2YNL209W 1842 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 MPS3YJL019W 2049 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 PIN4YBL051C 2007 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 MSH1YHR120W 2880 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 TAF7YMR227C 1773 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 VTC1YER072W 390 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 RPS22BYLR367W 393 nt4.97□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 CDC15YAR019C 2925 nt4.96□□□□□ -1.61
TFB4Q12004 HUL4YJR036C 2679 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 GDE1YPL110C 3672 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 YDL011CYDL011C 324 nt4.96□□□□□ -1.62
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