Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASGEF1BQ0VAM2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGEF1BQ0VAM2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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