Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCK1Q08629 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPOCK1Q08629 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334 ms