Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP4F3Q08477 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms