Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNK2Q07912 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms