Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAX8Q06710 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms