Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LTBQ06643 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LTBQ06643 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBQ06643 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LTBQ06643 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms