Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms