Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAV1Q03135 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms