Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB1Q02641 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms