Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP4Q02446 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP4Q02446 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms