Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms