Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELBQ01201 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RELBQ01201 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELBQ01201 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RELBQ01201 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELBQ01201 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELBQ01201 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELBQ01201 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms