Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDM2Q00987 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms